Exprese genu RNDR. MICHAELA KLEMENTOVÁ; 2017/2 …..JE VYJÁDŘENÍ INFORMACE OBSAŽENÉ V GENU (DNA) DO BÍLKOVINNÉ STRUKTURY Centrální dogma molekulární biologie Přenos genetické informace v živých organismech vždy DNA  RNA  protein Replikace  = zdvojení DNA  je proces tvorby kopií molekuly DNA, čímž se genetická informace přenáší z jedné molekuly DNA (templát, matrice) do jiné molekuly stejného typu (tzv. replika)  celý proces je semikonzervativní, tzn. každá nově vzniklá molekula DNA má jeden řetězec z původní molekuly a jeden nový, syntetizovaný Replikace  Celý proces probíhá semidiskontinuálně – vedoucí řetězec se syntetizuje kontinuálně, váznoucí řetězec se syntetizuje diskontinuálně – Okazakiho fragmenty  dochází k řazení nukleotidů jeden zadruhým, a to podle vzorové původní molekuly DNA  výsledkem tohoto řazení nukleotidů je nakonec kompletní DNA daného organizmu, v podstatě identická kopie původní DNA Replikace Enzymy:  DNA polymeráza, DNA primáza – katalyzuje polymeraci  DNA helikáza, DNA topoizomeráza, DNA ligáza  Iniciátorové a stabilizační enzymy Replikace  je v základních rysech stejná u všech organizmů a obecně je možné její průběh rozdělit do tří základních kroků:  Iniciace – rozpletení dvoušroubovice DNA, vznik replikační vidlice a navázání enzymatického komplexu  Elongace – přidávání nukleotidů a postup replikační vidlice  Terminace – ukončení replikace Replikace Iniciace  začíná připojením primerů na specifických místech – počátcích replikace  Eukaryota – i několik tisíc replikačních počátků  Bakterie – jeden počátek  Enzymatické rozvolnění vlákna mateřské DNA Replikace Elongace  DNA polymerázy provádí syntézu nových řetězců Terminace  Ukončení replikačního procesu Replikace  Bakterie – replikace má jeden nebo několik set replikačních počáteků (nukleoid – jedna kruhová DNA), replikace probíhá v kruhu  Eukaryota – více replikačních počátků, složitější enzymatické děje  Viry – popsaný proces využívají jen některé viry, své modifikace Replikace – replikační aparát Transkripce  = „přepis“ z DNA do mRNA  je proces, při němž je podle genetické informace zapsané v řetězci DNA vyráběn řetězec RNA.  probíhá u všech známých organizmů včetně virů. U bakterií se odehrává volně v cytoplazmě, u některých vyšších organizmů (tzv. eukaryota probíhá v buněčném jádře)  V centru transkripce stojí enzym RNA polymeráza, schopný podle vzoru v podobě DNA vyrábět kopii v podobě RNA Transkripce  Nejdříve se rozplete dvoušroubovice DNA, která se skládá z jednotlivých genů  RNA polymeráza se naváže na začátek genu a začne na nukleotidy DNA připojovat komplementární nukleotidy RNA  Když se do mRNA přepíše celý gen, jednořetězcová lineární molekula mRNA se odpojí a v typickém případě putuje k ribozomu, kde z ní v procesu translace vzniká bílkovina. Transkripce Fáze:  Iniciace – rozvine se dvoušroubovice DNA, začne se vytvářet RNA za´účasti RNA polymerázy  Elongace – prodlužování řetězce  Terminace – ukončení transkripce a uvolnění RNA molekuly; následuje několik posttranskripčních úprav, které ovšem nejsou součástí procesu transkripce Transkripce Posttranskripční úpravy  „Splicing“ …sestřih  Spočívá ve vystřižení nekodujících částí = intronů z původních vlákna a vlákno je dále tvořeno exony = kodující část vlákna, která jsou k sobě enzymaticky spojena Translace  = překlad  Translace neboli proteosyntéza je překlad nukleotidové sekvence mRNA do sekvence aminokyselin proteinu  Proces probíhá na ribosomech a jednotlivé aminokyseliny jsou zařazovány podle pravidel genetického kódu Translace Genetický kod  1. Tripletový - každá trojice bází kóduje jednu aminokyselinu - tyto úseky na mRNA se nazývají kodony Translace Genetický kod  2. Degenerovaný - pro asi 20 aminokyselin existuje mnohem více kódujících kodonů, z toho plyne, že některé aminokyseliny jsou kódované více triplety. Tato degenerace má své výhody například pokud dojde k bodové mutaci (substituci) na třetí pozici kodonu - je ve většině případů zařazena stejná aminokyselina. Translace Genetický kod  3. Univerzální - je platný pro všechny organismy na Zemi (existují ale i výjimky - např. u genetického kódu lidských mitochondrií)  celkem jsou 4 báze, takže pro kombinaci máme celkem 4x4x4=64 možností  triplet AUG - iniciační (zároveň kóduje methionin)  triplety UAA, UAG a UGA - terminační, neboli beze smyslu. Translace Pro translaci jsou zapotřebí:  RNA molekuly: mRNA (informační) – nese informaci o pořadí aminokyselin rRNA (ribosomální) - stavební jednotky ribosomu (kromě proteinů) tRNA (transferová) – přenašeč aminokyselin při syntéze proteinů na ribosomu  enzymy podmiňující jednotlivé reakce (eIF, GTP, ATP, aminokyseliny atd.) Translace  u prokaryot:  translace probíhá současně s transkripcí → tedy na jednom konci vznikající molekuly mRNA probíhá již translace a na druhém pokračuje transkripce;  u eukaryot:  transkripcí vzniká hnRNA (pre-mRNA) a následně dochází k posttranskripčním úpravám;  definitivní molekula mRNA je nejprve transportována z jádra do cytoplazmy pomocí transportních proteinů → pak teprve dochází na ribosomech k translaci;  proteiny, které vznikají na volných ribosomech, zůstanou pro buňku;  proteiny vzniklé na ribosomech endoplazmatického retikula pak buňka transportuje do extracelulárního prostoru. Translace Iniciace  iniciační tRNA (zvláštní tRNA přenášející AMK Methionin: Met-tRNAiMet), GTP (potřebný zdroj energie)…  komplex je navázán na malou podjednotku (40S) ribosomu;  k této malé podjednotce ribosomu připojena molekula mRNA  za pomoci energie získané štěpením ATP se molekula mRNA posunuje po malé jednotce ribosomu tak dlouho, dokud nenarazí na první triplet AUG (triplet pro Met) → dojde k otevření čtecího rámce (mechanismus zajišťující čtení informace po trojicích basí mRNA) a zahájení translace;  vzniklý komplex je následně spojen s větší podjednotkou ribosomu za pomoci energie uvolněné štěpením GTP Translace Elongace:  celý děj (systém kodon na mRNA – antikodon na tRNA) se opakuje až do doby, než je na molekule mRNA nalezen některý stop-kodon = terminační kodon (UAA, UAG, UGA); Terminace:  pak nastupuje další bílkovinný faktor (RF), který hotový polypeptid uvolní z ribosomálního komplexu.  Klíčová slova: genová exprese, replikace, transkripce, translace, proteosyntéza, DNA-polymeráza, RNApolymeráza, genetický kod a jeho vlastnosti