J 2022

METODIKA KOLEKTIVNÍHO ANTIGENNÍHO SCREENINGU NA PŘÍTOMNOST VIRU SARS-COV-2

BRYJOVÁ, Iveta, Radka STONIŠOVÁ and Daniela NEDVĚDOVÁ

Basic information

Original name

METODIKA KOLEKTIVNÍHO ANTIGENNÍHO SCREENINGU NA PŘÍTOMNOST VIRU SARS-COV-2

Name in Czech

METODIKA KOLEKTIVNÍHO ANTIGENNÍHO SCREENINGU NA PŘÍTOMNOST VIRU SARS-COV-2

Name (in English)

METHODOLOGY OF A GROUP ANTIGENIC SCREENING FOR SARS-COV-2

Authors

BRYJOVÁ, Iveta (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Radka STONIŠOVÁ (203 Czech Republic) and Daniela NEDVĚDOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution)

Edition

Ošetřovatelské perspektivy, Opava, 2022, 2570-785X

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

30100 3.1 Basic medicine

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

References:

RIV identification code

RIV/47813059:19510/22:A0000409

Organization unit

Faculty of Public Policies in Opava

DOI

Keywords (in Czech)

Antigenní test; senzitivita; specificita; screening; skupinové testování; COVID-19; SARS- CoV-2

Keywords in English

Antigen test; sensitivity; specificity; screening; group testing; COVID-19; SARS-CoV-2

Tags

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 21/3/2023 14:55, Jana Tamfalová

Abstract

ORIG EN

V originále

Východiska: Práce vychází z jednoho ze známých algoritmů kolektivního testování – metody skupinového testu sloučených vzorků – kterou experimentálně ověřujeme při povinném plošném screeningu pomocí POC antigenních testů v souvislosti s šířením nákazy COVID-19. Cíl: Verifikovat metodu a stanovit doporučení pro skupinové testování na kvalitativní stanovení přítomnosti antigenu viru SARS-CoV-2 prostřednictvím POC antigenních testů v rámci celoplošného screeningu. Metody: Experimentální pilotní studie s použitím POC testovacích sad pro kvalitativní detekci virových nukleoproteinových antigenů SARS-CoV-2 z přímých nazálních, nazofaryngeálních nebo orofaryngeálních výtěrů u vybrané populace doporučenou metodikou testování a metodikou kolektivního (skupinového) testování. Výsledky a diskuze: Porovnali jsme optimalizaci rozsahu kolektivně testované skupiny s citlivostí POC testovacích sad. Tato citlivost nedostačuje pro optimalizované rozsahy (okolo 10 vzorků) pro odhadovanou prevalenci mezi 1 % až 2 %, avšak citlivosti testovacích sad redukované optimální rozsahy (do pěti vzorků) nabízejí nezanedbatelnou úsporu. Závěry: Navrhujeme testovací protokol kolektivního testování pětičlenných skupin, které za předpokladu 1 % až 2 % prevalence poskytují faktor úspory materiálu 0,25–0,3.

In English

Background: This paper is based on one of the algorithms of collective testing, the method of group screening, which we experimentally verify during mandatory screening using POC antigen tests in connection with the spread of COVID-19. Aim: To verify the model and make recommendations for collective testing for qualitative determination of SARS-CoV-2 antigen detection by POC antigen tests in the context of population-wide screening. Methods: POC antigen test kits for the qualitative detection of SARS-CoV-2 viral nucleoprotein antigens from direct nasal, nasopharyngeal, or oropharyngeal swabs in a selected population using recommended testing and collective (group) testing methodologies. Results and discussion: We compared the optimization of the size of the collectively tested group with the sensitivity of the POC test sets. This sensitivity is not sufficient for optimized size (around 10 samples) for an estimated prevalence between 1 % and 2 %, but even the size cut down by the test sensitivity (up to 5 samples) provides not negligible savings. Conclusions: We propose a test protocol for collective testing of five-member groups, which, assuming a 1 % to 2 % prevalence, provide a material saving factor of 0,25–0.3.